消えません。
ここに記載の状態です。以下にその部分を引用します。
ただ新しいアイコンやランチャを追加するには、既存のアイテム上で右クリックし適切なアクションをDesktopサブメニューの中から選ぶという方法しか用意されていない。他のデスクトップ環境ではフォルダやショートカットの作成にはデスクトップ自体を右クリックするのだが、Xfceではデスクトップで右クリックするとXfceのアプリケーションメニューが立ち上がった。また不思議なことに、新しく作成したフォルダが再びXfceへログインし直すまで現れないこともあるかと思えば、また別の時には直ちに現れたりすることもあった。また別の思いがけないこととして、ファイルやフォルダやランチャのアイコンを削除したのに何も起こらない（ように見える）ということがあった。ところがもう一度試すと、デスクトップ上では存在しているように見えているのに、 Xfceがそのようなリソースは存在しないと警告することがあった。
ゴミ箱はタスクトレイにあるし、今のところデスクトップに置くべきファイルやフォルダアイコンは無いので直接的な影響はありませんが、気分的に気になります。
# xubuntuではこのような動作はありません。
# 何を書き換えればいいのかな?
なお、最小化されたアプリアイコンの表示には何も問題ありません。
